La mayor diferencia entre el tatuaje y la micropigmentación es la profundidad de inserción del pigmento. En micropigmentación se trabaja en la capa más superficial de la piel, en la epidermis, mientras que en el tatuaje se llega a la dermis. También en micropigmentación los pigmentos son diferentes, colores mas naturales, la técnica de trabajo es diferente, la maquinaria más pesada, etc. Por ello el tatuaje es permanente y la micropigmentación no.